По закону такой сотрудник не может выполнять свои обязанности.

Поэтому от работы его придется отстранить.
А дальше выполнить несколько шагов:
- Фиксируем в протоколе результат проверки.
- Сообщаем руководству, что работника придется отстранить.
- Назначаем дату повторной проверки знаний (не позже, чем через месяц после прошлой попытки).