5 января 1996 года погиб от минно-взрывной травмы, приведшей к разрушению тела. За мужество и героизм, проявленные при выполнении специального задания, Указом Президента РФ № 622 от 2 мая 1996 года гвардии майору Родионову Евгению Николаевичу присвоено посмертно звание Героя Российской Федерации. 13 января 1996 года похоронен на кладбище Сухомесово г.Челябинск. На его могиле установлен обелиск. На здании школы № 68, где учился Евгений, и в школьном музее установлены мемориальные доски. Одна из улиц г.Челябинск названа его именем.