Redmine имеет поддержку нескольких проектов.

Интеграция по всей системе великолепна. Вы можете создавать вложенные подпроекты и перемещать отчёты об ошибках и тикеты из одного проекта в другой. Для каждого проекта вы можете назначать различных пользователей и подключать или отключать определенную функциональность (план работ, отслеживание времени, управление исходным кодом и т.д.). Redmine с первого взгляда понравился тем, что позволяет гибко настраивать почти всё из интерфейса, тем, что в нём уже есть много полезного, но в то же время нет ничего сверхненужного. http://oblaqo.ru/news/avtomatizirovannaya-sistema-upravleniya-proektami-na-predpriyatii-vnedrenie-i-podderzhka