Где брать разрешение для удаления деревьев на кладбище?

На каждом кладбище имеется администрация, однако на сельском может отсутствовать.
По закону к удалению деревьев можно приступить только после согласования действий с администрацией кладбища.
Поэтому, вам необходимо обратиться в администрацию сельского поселения, лучше конечно письменно и получить от них разрешение, чтобы потом не предъявили к вам претензии (ст. 8.28 КоАП РФ).
Ст.209 ГК РФ
Федеральный закон от 12.01.1996 N 8-ФЗ (ред. от 01.10.2019) "О погребении и похоронном деле"