Миссия Ботанического сада ЮФУ состоит в изучении, сохранении, мобилизации и рациональном использовании биологического разнообразия растений степной зоны; сохранении мировой флоры в коллекциях и экспозициях, обогащении культивируемой в регионе флоры, развитии образовательной и культурной среды на благо ныне живущих и будущих поколений. Основное научное направление: Оценка состояния, мониторинг и проблемы сохранения биологического разнообразия в степной зоне. Рациональное использование и воспроизводство биологических ресурсов в условиях антропогенного воздействия.