Фамилия Дайнеко образована от прозвища, которое указывало на социальное положение определенного человека.

В XVII веке Дайнеко называли украинского казака, вооруженного дубиной. Скорее всего, предок обладателя фамилии Дайнеко принадлежал к казачеству, военному сословию в России XVIII — начала XX веков