Другие приложения могут быть разработаны с помощью Xcode для Mac и iPhone, iPod Touch и iPad, Codea[28] для iPad, и опубликованы в App Store — онлайн-магазине, который поставляется с самим iPhone/iPod touch/iPad, начиная с версии iPhone OS 2.

0, и является крупнейшим магазином мобильных приложений (на июнь 2013 года — более 900 тыс. приложений для iOS, более 350 тыс. приложений специально для iPad). Формат установочных пакетов — .ipa. Для установки приложения должны быть подписаны сертификатом, выпущенным компанией Apple,[29] что делает операционную систему наиболее безопасной(разработчики могут получить временный сертификат для установки приложений на ограниченном числе устройств). Запуск неподписанных приложений в некоторых версиях возможен после процедуры Jailbreak