По итогам проверки Счетная палата отметила как значительное перевыполнение, так и недовыполнение прогнозных показателей в части доходов проверенных объектов.

В то время как министерство в 2,5 раза перевыполнило прогноз по доходам, Росздравнадзор и Роспотребнадзор, напротив, не достигли запланированных показателей.
Общая сумма финансовых нарушений, выявленных в Минздраве и исследовательском центре имени А. Н. Бакулева, составила 991,2 млн рублей. Из них в ходе проверки возвращено в федеральный бюджет 37,9 млн рублей. Наиболее существенные нарушения касаются сферы закупок и предоставления учреждениям субсидий на выполнение госзадания.
В Росздравнадзоре основные нарушения связаны с проведением текущего ремонта на объекте культурного наследия:
Работы на общую сумму 12,7 млн рублей были приняты и оплачены Службой при отсутствии у подрядчика разрешения на их выполнение
Подрядчику не предъявлялись требования об уплате неустоек за неисполнение обязательств по контракту
В Роспотребнадзоре установлены отдельные нарушения и недостатки:
Несоблюдение правил ведения бухучета и требований к осуществлению внутреннего финансового аудита.
Отсутствие мер по возврату в федеральный бюджет неотработанного аванса по контракту, заключенному подведомственным учреждением, на сумму 509,5 млн рублей
Счетная палата