ИФНС России по городу и космодрому Байконуру является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по контролю и надзору за соблюдением законодательства о налогах и сборах. ИФНС России по городу и космодрому Байконуру находится в ведении Министерства финансов Российской Федерации.