Государственное учреждение «Краевой центр оценки качества образования Забайкальского края» создано на основании Распоряжения Администрации Читинской области № 700-А/р от 17.12.2002 года) «О создании государственных предприятий, учреждений».
В соответствии с Распоряжением, ГУ КЦОКО Забайкальского края переданы функции по информационному, организационному, технологическому и техническому обеспечению проведения государственной итоговой аттестации и аттестации педагогических работников, обеспечению функционирования и развития системы оценки качества образования Забайкальского края.