Рутульский район расположен на юго-западе Дагестана и граничит с Агульским, Ахтынским, Кулинским, Курахским, Лакским, Тляратинский и Чародинским районами республики. Западная часть района граничит с Азербайджаном на протяжении 110 км, на этом участке границы находятся 4 пограничные заставы[источник?]. Площадь территории — 2170 км². Координаты: 41,654148° с. ш. 47,157799° в. д. В Рутульском районе протекают реки Самур, Кара-Самур, Ахтычай, Курдул, Шиназчай. Районный центр с. Рутул отдалён от ближайшей железнодорожной станции Белиджи на 150 км, а от столицы Республики г. Махачкала на 280 км.